MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 70999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_011312	ATT	2	6	123202	123207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693716
2503	NC_011312	TGA	2	6	123265	123270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
2504	NC_011312	TTG	2	6	123293	123298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693716
2505	NC_011312	AAT	2	6	123302	123307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693716
2506	NC_011312	TATT	2	8	123344	123351	25 %	75 %	0 %	0 %	209693716
2507	NC_011312	TTG	2	6	123405	123410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693716
2508	NC_011312	GTA	2	6	123431	123436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
2509	NC_011312	GAT	3	9	123440	123448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
2510	NC_011312	TATT	2	8	123454	123461	25 %	75 %	0 %	0 %	209693716
2511	NC_011312	CGTGG	2	10	123462	123471	0 %	20 %	60 %	20 %	209693716
2512	NC_011312	TTATT	2	10	123489	123498	20 %	80 %	0 %	0 %	209693716
2513	NC_011312	TAA	2	6	123592	123597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693716
2514	NC_011312	GAT	2	6	123671	123676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
2515	NC_011312	ATC	2	6	123771	123776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693716
2516	NC_011312	G	6	6	123833	123838	0 %	0 %	100 %	0 %	209693716
2517	NC_011312	TC	3	6	123849	123854	0 %	50 %	0 %	50 %	209693716
2518	NC_011312	CAT	2	6	123871	123876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693716
2519	NC_011312	TCT	2	6	123889	123894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693716
2520	NC_011312	TGA	2	6	123904	123909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
2521	NC_011312	AC	3	6	123936	123941	50 %	0 %	0 %	50 %	209693716
2522	NC_011312	GTTT	2	8	124008	124015	0 %	75 %	25 %	0 %	209693716
2523	NC_011312	GTT	2	6	124094	124099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693716
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2526	NC_011312	ATG	2	6	124337	124342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
2527	NC_011312	GAAGAT	2	12	124352	124363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209693716
2528	NC_011312	TGCA	2	8	124392	124399	25 %	25 %	25 %	25 %	209693716
2529	NC_011312	AGA	2	6	124441	124446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693716
2530	NC_011312	TGA	2	6	124474	124479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
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2532	NC_011312	CGT	2	6	124499	124504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693716
2533	NC_011312	A	7	7	124531	124537	100 %	0 %	0 %	0 %	209693716
2534	NC_011312	CGT	2	6	124565	124570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693716
2535	NC_011312	T	6	6	124606	124611	0 %	100 %	0 %	0 %	209693716
2536	NC_011312	AGA	2	6	124612	124617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693716
2537	NC_011312	GAT	2	6	124628	124633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693716
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2539	NC_011312	AAG	2	6	124668	124673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693716
2540	NC_011312	AG	3	6	124672	124677	50 %	0 %	50 %	0 %	209693716
2541	NC_011312	A	6	6	124724	124729	100 %	0 %	0 %	0 %	209693716
2542	NC_011312	AATA	2	8	124748	124755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_011312	GCA	2	6	124861	124866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693717
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2545	NC_011312	GCATT	2	10	124910	124919	20 %	40 %	20 %	20 %	209693717
2546	NC_011312	GAG	2	6	124970	124975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209693717
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2549	NC_011312	CAA	2	6	125087	125092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693717
2550	NC_011312	GCA	2	6	125167	125172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693717
2551	NC_011312	GCA	2	6	125197	125202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693717
2552	NC_011312	CGA	2	6	125210	125215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693717
2553	NC_011312	TTA	3	9	125263	125271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_011312	AGC	2	6	125313	125318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_011312	A	6	6	125324	125329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_011312	CGC	2	6	125331	125336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2557	NC_011312	TTG	2	6	125378	125383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_011312	A	6	6	125454	125459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_011312	A	8	8	125462	125469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_011312	TAT	2	6	125496	125501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_011312	CCG	2	6	125508	125513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_011312	AGT	2	6	125637	125642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_011312	GGT	2	6	125685	125690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_011312	ATT	2	6	125719	125724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_011312	CGAAA	2	10	125790	125799	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2567	NC_011312	TA	3	6	125907	125912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_011312	A	6	6	125912	125917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_011312	TGG	2	6	125922	125927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_011312	GGT	2	6	125965	125970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_011312	ATG	2	6	126032	126037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_011312	A	6	6	126077	126082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_011312	T	6	6	126192	126197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_011312	TAT	2	6	126211	126216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_011312	TCA	2	6	126225	126230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2577	NC_011312	CTT	2	6	126262	126267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_011312	TCT	3	9	126270	126278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_011312	TATT	2	8	126457	126464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_011312	ATT	2	6	126467	126472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_011312	GTT	2	6	126481	126486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_011312	TAT	2	6	126487	126492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_011312	GATA	2	8	126517	126524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_011312	ATT	2	6	126547	126552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_011312	TAG	2	6	126572	126577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_011312	CTG	2	6	126643	126648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2592	NC_011312	TGC	2	6	126693	126698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_011312	AGT	2	6	126701	126706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2595	NC_011312	GTT	2	6	126830	126835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_011312	AGA	2	6	126958	126963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_011312	ATTT	2	8	126994	127001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_011312	ATC	2	6	127084	127089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_011312	AGA	2	6	127090	127095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_011312	TGA	2	6	127119	127124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_011312	TGG	2	6	127183	127188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_011312	ATT	2	6	127241	127246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_011312	CAA	2	6	127257	127262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_011312	TCAT	2	8	127456	127463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2605	NC_011312	AC	3	6	127464	127469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2606	NC_011312	TTA	2	6	127531	127536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_011312	AGA	2	6	127538	127543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_011312	GTC	2	6	127681	127686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_011312	TTA	2	6	127792	127797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_011312	CGT	2	6	127887	127892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_011312	TCAGAA	2	12	127995	128006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2612	NC_011312	TGG	2	6	128087	128092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011312	TTA	2	6	128142	128147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_011312	TGA	2	6	128153	128158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_011312	TTA	2	6	128205	128210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_011312	TGT	2	6	128242	128247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_011312	TG	3	6	128281	128286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_011312	TA	3	6	128344	128349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_011312	A	6	6	128373	128378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_011312	AAC	2	6	128422	128427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2623	NC_011312	GATT	2	8	128470	128477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_011312	TGC	3	9	128557	128565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693718
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2628	NC_011312	TGA	2	6	128887	128892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693718
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3000	NC_011312	CTT	2	6	145036	145041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693733

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